Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms