Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2L3P68036 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms