Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms