Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECI1P42126 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECI1P42126 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECI1P42126 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms