Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP62P37198 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms