Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms