Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms