Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NGFRP08138 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NGFRP08138 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NGFRP08138 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms