Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK4O60575 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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