Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms