Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGPEP1LA6NFU8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms