Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms