Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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TRBV20-1A0A075B6N2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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TRBV20-1A0A075B6N2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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TRBV20-1A0A075B6N2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV20-1A0A075B6N2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV20-1A0A075B6N2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV20-1A0A075B6N2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV20-1A0A075B6N2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRBV20-1A0A075B6N2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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