Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079594.2-201ENST00000483754 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF3-213ENST00000619554 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM15-201ENST00000339020 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOL12-201ENST00000359114 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXW7-204ENST00000393956 1735 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM47A-201ENST00000346193 2556 ntAPPRIS P2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A17-210ENST00000435456 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF438-204ENST00000413025 3106 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSEN1-204ENST00000394164 3046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL15-210ENST00000456530 2835 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLA-DOA-201ENST00000229829 3489 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 L3MBTL3-203ENST00000368139 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356289.3-201ENST00000640049 2669 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBED9-201ENST00000452236 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPTC-201ENST00000367222 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGEB17-201ENST00000400003 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms