Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TRIM39-203ENST00000396547 3187 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PSME3-205ENST00000545225 3082 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PAX6-273ENST00000640610 2730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01166-201ENST00000443633 2619 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM124B-203ENST00000409685 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RIPOR2-202ENST00000378023 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SYNPR-212ENST00000479198 2436 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ITGAL-202ENST00000358164 4673 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF383-207ENST00000589413 2268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ZP2-204ENST00000574091 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL157815.1-201ENST00000635484 2117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CES5A-202ENST00000319165 2016 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC009948.1-205ENST00000453026 2007 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF619-210ENST00000522736 2030 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 OR4D2-202ENST00000641866 2011 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00667-205ENST00000582008 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SCOC-AS1-201ENST00000512692 1987 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 BX005214.3-201ENST00000615174 1988 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFRSF9-201ENST00000377507 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CSF2RA-209ENST00000432318 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SAMMSON-218ENST00000641601 1847 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TACC2-201ENST00000260733 3644 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ZSCAN9-202ENST00000425468 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MCM5-201ENST00000216122 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC016582.1-201ENST00000592640 1716 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC011199.1-201ENST00000625022 3362 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC005524.1-201ENST00000636857 1674 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SVIP-201ENST00000354193 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MSRB3-201ENST00000308259 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PRAMEF30P-201ENST00000438176 1417 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 QARS-201ENST00000306125 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC020978.10-201ENST00000623181 2704 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 OR11A1-203ENST00000377149 2611 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU1-34P-201ENST00000364421 157 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ACBD5-204ENST00000375905 3848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.8 ms