Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGC1AQ9UBK2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms