Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms