Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD3Q9NX63 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms