Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATAD3AQ9NVI7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATAD3AQ9NVI7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms