Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC6A13Q9NSD5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms