Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms