Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTORQ9NRC9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTORQ9NRC9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms