Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG5Q9H1Y0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG5Q9H1Y0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms