Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms