Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1R9BQ96SB3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms