Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231 ms