Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD27Q96NW4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD27Q96NW4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms