Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms