Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C18orf8Q96DM3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms