Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C15orf40Q8WUR7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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C15orf40Q8WUR7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C15orf40Q8WUR7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C15orf40Q8WUR7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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C15orf40Q8WUR7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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C15orf40Q8WUR7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C15orf40Q8WUR7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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