Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC150Q8NCX0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC150Q8NCX0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms