Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIX1LQ8IVB5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIX1LQ8IVB5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIX1LQ8IVB5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIX1LQ8IVB5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIX1LQ8IVB5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIX1LQ8IVB5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms