Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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