Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIAT1Q6ZQX7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIAT1Q6ZQX7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIAT1Q6ZQX7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIAT1Q6ZQX7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIAT1Q6ZQX7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIAT1Q6ZQX7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms