Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.149e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.19e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.069e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PEF1-207ENST00000492061 936 ntTSL 315.13■□□□□ 0.019e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.019e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 09e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 CAPN2-207ENST00000480581 513 ntTSL 214.82□□□□□ -0.049e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 AP3S1-204ENST00000506430 718 ntTSL 514.78□□□□□ -0.049e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 STAMBP-206ENST00000432295 1156 ntTSL 514.62□□□□□ -0.079e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PSMD13-211ENST00000532025 653 ntTSL 314.48□□□□□ -0.099e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 FAM76B-202ENST00000398187 3823 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.099e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PPFIA3-202ENST00000421230 2236 ntTSL 214.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.169e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.169e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 AP3S1-208ENST00000515066 1670 ntTSL 213.93□□□□□ -0.189e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.289e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.39e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 DEPDC7-204ENST00000532078 1118 ntTSL 213.18□□□□□ -0.39e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.39e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.359e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 STAMBP-207ENST00000452725 560 ntTSL 49.87□□□□□ -0.839e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 LETM1-203ENST00000505551 2710 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.831e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NSUN4-202ENST00000469918 865 ntTSL 39.68□□□□□ -0.869e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PEF1-205ENST00000478502 750 ntTSL 29.62□□□□□ -0.879e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.889e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.899e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ADM-204ENST00000526492 641 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R3E-204ENST00000559942 1187 ntTSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.99e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MAGOHB-210ENST00000546173 576 ntTSL 49.4□□□□□ -0.99e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R3E-203ENST00000559314 2351 ntTSL 29.33□□□□□ -0.929e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 BRD7-205ENST00000562383 2580 ntTSL 59.1□□□□□ -0.959e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 VANGL1-203ENST00000369509 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.989e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R3E-202ENST00000558058 3222 ntTSL 38.83□□□□□ -19e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.011e-18■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR3-207ENST00000511594 2288 ntTSL 58.64□□□□□ -1.039e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 XPO1-222ENST00000492182 827 ntTSL 28.63□□□□□ -1.038e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PDZD11-203ENST00000473667 630 ntTSL 48.54□□□□□ -1.049e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SPATA6-208ENST00000487543 599 ntTSL 58.41□□□□□ -1.069e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 PDZD11-202ENST00000374454 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.099e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.19e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF615-209ENST00000599115 535 ntTSL 48.01□□□□□ -1.139e-10■■■■■ 36.7
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