Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms