Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms