Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME3Q16798 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME3Q16798 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME3Q16798 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ME3Q16798 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ME3Q16798 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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