Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSRP2Q16527 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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