Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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