Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms