Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms