Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HBBP68871 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HBBP68871 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HBBP68871 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms