Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms