Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD34P28906 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD34P28906 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD34P28906 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD34P28906 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD34P28906 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD34P28906 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD34P28906 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms