Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms