Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA21P01568 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms