Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA1P01562 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms