Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms