Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms